Jelena Franjković zaposlila se početkom 2012. godine u osječkoj tvrtki Kandit d.o.o. u odjelu izvoza, gdje je radila na poslovima voditelja stranih tržišta. Na Ekonomskom fakultetu u Osijeku zaposlena je od 2014. godine na Katedri za marketing. Na radnom mjestu poslijedoktorandice sudjeluje u izvođenju nastave više kolegija na preddiplomskom i diplomskom studiju.
Od 2014. godine je članica organizacijskog odbora međunarodne znanstvene konferencije “Business Logistics in Modern Management” te međunarodne znanstvene konferencije “Interdisciplinary Management Research” u 2018. i 2019. godini. Sudjelovala je kao član projektnog tima na dva međunarodna Erasmus+ projekta.
Dosada je u koautorstvu s drugim autorima objavila više od 20 znanstvenih i stručnih radova u časopisima i zbornicima s međunarodnih konferencija. Više puta sudjelovala je u stručnim usavršavanjima i održavala nastavu u sklopu Erasmus+ mobilnosti. Koordinatorica je za dolazne Erasmus+ studente na Ekonomskom fakultetu u Osijeku.
Na internoj edukaciji Ekonomskog fakulteta u Osijeku u veljači 2016.g. pohađala je tečaj Statističke metode u istraživačkom radu, a u svibnju 2018. statističku edukaciju za modeliranje strukturnih jednadžbi.