Jelena Franjković zaposlila se početkom 2012. godine u osječkoj tvrtki Kandit d.o.o. u odjelu izvoza, gdje je radila na poslovima voditelja stranih tržišta. Na Ekonomskom fakultetu u Osijeku zaposlena je od 2014. godine na Katedri za marketing. Na radnom mjestu docentice izvodi nastavu na više kolegija na diplomskom studiju.
Od 2014. godine je članica organizacijskog odbora međunarodne znanstvene konferencije “Business Logistics in Modern Management”, a od 2022. i članica Uredništva zbornika konferencije. Sudjelovala je kao član projektnog tima na tri međunarodna Erasmus+ projekta.
Dosada je u koautorstvu s drugim autorima objavila više od 20 znanstvenih i stručnih radova u časopisima i zbornicima s međunarodnih konferencija. Više puta sudjelovala je u stručnim usavršavanjima i održavala nastavu u sklopu Erasmus+ mobilnosti. Koordinatorica je za dolazne Erasmus+ studente na Ekonomskom fakultetu u Osijeku.
Na internoj edukaciji Ekonomskog fakulteta u Osijeku u veljači 2016.g. pohađala je tečaj Statističke metode u istraživačkom radu, a u svibnju 2018. statističku edukaciju za modeliranje strukturnih jednadžbi.
