Antoaneta Klobučar je zaposlena od 1986. godine na Ekonomskom fakultetu u Osijeku na Katedri za matematiku i informatiku. Od 2020. godine radi na mjestu redovitog profesora u trajnom zvanju na Katedri za matematičke metode i informatiku Ekonomskog fakulteta u Osijeku. Objavila je preko 30 znanstvenih i stručnih radova, ponajviše tematski vezane za teoriju grafova. Fokus znanstvenog usmjerenja i istraživanja predstavljaju dominacije na raznim vrstama grafova i općenito kombinatorni problemi. Sudjeluje u izvođenju nastave iz više nastavnih predmeta na različitim razinama studija unutar matične ustanove te kao vanjski suradnik gostovala je na Odjelu za matematiku i Odjelu za fiziku Sveučilišta J.J Stossmayera u Osijeku, kao i na Filozofskom fakultetu u Osijeku.
U više navrata boravila je na Montanuniversitetu u Leobenu, Austrija kod prof.dr.sc Norberta Seiftera koji joj je bio mentor doktorske radnje.
Od 2011. do 2014. godine bila je voditelj međunarodnog individualnog projekta "Neke primjene geometrijskih reprezentacija grafova" u okviru CRP projekta " Geometrijske reprezentacije i simetrije na grafovima, mape i druge diskretne srukture i primjene u znanosti. Član je Hrvatskog matematičkog drušva (HMD).
